De vereniging is door de eerste studenten Bioprocestechnologie opgericht op 16 september 1991, rond de eettafel op Dijkgraaf 1b, een jaar nadat de studie werd opgestart. Op dit moment draagt de vereniging nog de naam "BiPS", die later zal worden veranderd in CODON. De eerste voorzitter van de vereniging is Ronald Neeleman.
Nadat aan het begin van de 21ste eeuw een steeds groter wordend aantal buitenlandse studenten voor de studie biotechnologie kiest, verwisselt de vereniging zijn voertaal geleidelijk van het Nederlands naar het Engels. Naast de almanakken, die tweetalig of geheel in het Engels worden uitgebracht, worden op dit moment ook de officiële documenten van de vereniging in het Engels vertaald. De groei van buitenlandse studenten leidt in het voorjaar van 2006 zelfs tot de oprichting van een nieuwe commissie, de "integrase", welke integratie tussen de verschillende nationaliteiten binnen biotechnologie tot doel heeft.
CODON heeft op dit moment de beschikking over een ruime bestuurskamer met omliggende faciliteiten in de proceshal van "het biotechnion", waar naast het bestuur ook veel leden actief bezig zijn met het regelend van de activiteiten binnen de studievereniging. Of CODON deze kamer in de toekomst zal behouden is nog onduidelijk, aangezien Wageningen Universiteit nog geen zekerheden kan geven over de mogelijke verhuizing van de gehele universiteit naar een nieuwe campus, net noordelijk van Wageningen.
